Anime School Animal Simulator — це тривимірний аніме-екшн з елементами яндере та RPG, дія якого відбувається в школі. Головна героїня, Аяно, є типовим персонажем яндере, який приходить до школи лише для того, щоб дізнатися, що замість звичайних учнів вона стикається з тваринами-мутантами. Ці мутанти колись були її однокласниками, і тепер вона повинна боротися з ними, досліджувати школу, розкривати таємниці та знайти спосіб повернути своїх друзів до їх нормальної форми.
Аяно має не лише боротися з мутантами, а й врятувати своїх друзів від подальшого зараження та знайти спосіб зупинити поширення мутації. Протягом усієї гри вона розкриватиме таємницю мутантів і шукатиме рішення, щоб зупинити це жахливе явище. У грі 15 рівнів, кожен з яких наповнений діями, головоломками та битвами з босами.
Гравцям потрібно буде придбати зброю та одяг, які забезпечують захист і покращують здібності Аяно, допомагаючи їй вижити в цій небезпечній ситуації. Одяг і зброя мають вирішальне значення в боях з мутантами і могутніми босами. Гра також включає елементи дослідження, де Аяно має шукати різні частини школи, щоб знайти підказки та рішення проблеми.
Аяно також зустрічає своє кохання, Таро, і її почуття до нього стають більш інтенсивними та небезпечними, додаючи елементи яндере до сюжетної лінії. Протягом усієї гри Аяно боротиметься зі своїми емоціями та прихильністю до Таро, оскільки її любов до нього може стати загрозою не лише для неї самої, а й для оточуючих.
Anime School Animal Simulator поєднує в собі елементи аніме, яндере, шкільної симуляції та рольової гри, пропонуючи гравцям унікальну історію, де вони не лише борються з мутантами та розкривають секрети, але й намагаються врятувати своїх друзів і зупинити поширення руйнівної інфекції.